MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp34

Total Repeats: 1129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008566	CCT	2	6	10	15	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008566	CAA	2	6	24	29	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008566	GAA	2	6	68	73	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008566	ATC	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008566	T	6	6	140	145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008566	TTA	2	6	206	211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008566	CTC	2	6	217	222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008566	T	6	6	284	289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008566	AT	3	6	317	322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008566	CAA	2	6	351	356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008566	TCA	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008566	CAA	2	6	366	371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008566	TCA	2	6	374	379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008566	ACT	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008566	A	7	7	409	415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008566	AAC	2	6	450	455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008566	CCAA	2	8	485	492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008566	CTG	2	6	518	523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008566	AT	3	6	534	539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008566	T	6	6	596	601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008566	A	6	6	604	609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008566	ATT	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008566	TAA	2	6	686	691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008566	ATT	3	9	696	704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008566	TAT	2	6	714	719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008566	ATTA	2	8	739	746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008566	ATTA	2	8	772	779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008566	ATTA	2	8	838	845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008566	ATTA	2	8	855	862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008566	ATTA	2	8	887	894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008566	GAG	2	6	908	913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008566	ATATA	2	10	926	935	60 %	40 %	0 %	0 %	117621707
33	NC_008566	TTGT	2	8	945	952	0 %	75 %	25 %	0 %	117621707
34	NC_008566	T	6	6	959	964	0 %	100 %	0 %	0 %	117621707
35	NC_008566	A	7	7	1020	1026	100 %	0 %	0 %	0 %	117621707
36	NC_008566	A	6	6	1041	1046	100 %	0 %	0 %	0 %	117621707
37	NC_008566	AGA	2	6	1067	1072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
38	NC_008566	AGA	2	6	1085	1090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
39	NC_008566	AGA	2	6	1103	1108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
40	NC_008566	AGA	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
41	NC_008566	A	6	6	1142	1147	100 %	0 %	0 %	0 %	117621707
42	NC_008566	TGA	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621707
43	NC_008566	A	7	7	1199	1205	100 %	0 %	0 %	0 %	117621707
44	NC_008566	A	8	8	1210	1217	100 %	0 %	0 %	0 %	117621707
45	NC_008566	AGA	2	6	1223	1228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
46	NC_008566	TTGGG	2	10	1266	1275	0 %	40 %	60 %	0 %	117621707
47	NC_008566	A	6	6	1291	1296	100 %	0 %	0 %	0 %	117621707
48	NC_008566	ATA	2	6	1303	1308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621707
49	NC_008566	AG	3	6	1310	1315	50 %	0 %	50 %	0 %	117621707
50	NC_008566	TGT	2	6	1399	1404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621707
51	NC_008566	CTT	2	6	1439	1444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621707
52	NC_008566	GAC	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621707
53	NC_008566	A	6	6	1485	1490	100 %	0 %	0 %	0 %	117621707
54	NC_008566	TTG	2	6	1539	1544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621707
55	NC_008566	ATT	2	6	1550	1555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621707
56	NC_008566	TTA	2	6	1596	1601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621707
57	NC_008566	TAA	2	6	1640	1645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621707
58	NC_008566	AGA	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
59	NC_008566	AAG	2	6	1696	1701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
60	NC_008566	TACAA	2	10	1727	1736	60 %	20 %	0 %	20 %	117621707
61	NC_008566	GTAT	2	8	1749	1756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008566	TTA	2	6	1785	1790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008566	A	6	6	1822	1827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008566	T	6	6	1875	1880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008566	TAA	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008566	ATT	2	6	1925	1930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008566	TCT	2	6	1945	1950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008566	AAG	2	6	1955	1960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008566	TAAT	2	8	1981	1988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008566	ATTA	2	8	1995	2002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008566	TAA	2	6	2017	2022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008566	CAAA	2	8	2033	2040	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008566	TA	3	6	2049	2054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008566	TTA	2	6	2069	2074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008566	AATC	2	8	2081	2088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008566	TTA	2	6	2095	2100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008566	ATAC	2	8	2162	2169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008566	TGG	2	6	2170	2175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008566	GTA	2	6	2192	2197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008566	ATA	2	6	2224	2229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008566	TTA	2	6	2242	2247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008566	AAT	2	6	2257	2262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008566	TA	3	6	2276	2281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008566	A	8	8	2293	2300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008566	TAC	2	6	2344	2349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008566	A	7	7	2366	2372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008566	T	6	6	2394	2399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008566	T	6	6	2404	2409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008566	TA	3	6	2460	2465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008566	T	6	6	2466	2471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008566	ATA	2	6	2483	2488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621708
92	NC_008566	ATTT	2	8	2514	2521	25 %	75 %	0 %	0 %	117621708
93	NC_008566	AT	3	6	2536	2541	50 %	50 %	0 %	0 %	117621708
94	NC_008566	AC	3	6	2565	2570	50 %	0 %	0 %	50 %	117621708
95	NC_008566	AT	3	6	2571	2576	50 %	50 %	0 %	0 %	117621708
96	NC_008566	TAT	3	9	2703	2711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008566	A	7	7	2741	2747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008566	GTT	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008566	TTC	2	6	2810	2815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008566	TAT	2	6	2853	2858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008566	GCAAGT	2	12	2879	2890	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_008566	ATA	2	6	2891	2896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008566	ACTT	2	8	2911	2918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008566	ATT	2	6	2931	2936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008566	AAT	2	6	2973	2978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008566	AAG	2	6	3000	3005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008566	AT	4	8	3044	3051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008566	A	6	6	3052	3057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008566	T	7	7	3062	3068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008566	TA	3	6	3103	3108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008566	AGC	2	6	3158	3163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621709
112	NC_008566	A	6	6	3170	3175	100 %	0 %	0 %	0 %	117621709
113	NC_008566	TAT	2	6	3178	3183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621709
114	NC_008566	T	7	7	3195	3201	0 %	100 %	0 %	0 %	117621709
115	NC_008566	TTTA	2	8	3203	3210	25 %	75 %	0 %	0 %	117621709
116	NC_008566	TAA	2	6	3229	3234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621709
117	NC_008566	AT	3	6	3253	3258	50 %	50 %	0 %	0 %	117621709
118	NC_008566	CTG	2	6	3274	3279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621709
119	NC_008566	T	6	6	3315	3320	0 %	100 %	0 %	0 %	117621709
120	NC_008566	T	7	7	3325	3331	0 %	100 %	0 %	0 %	117621709
121	NC_008566	TTTAA	2	10	3400	3409	40 %	60 %	0 %	0 %	117621710
122	NC_008566	CAT	2	6	3509	3514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621710
123	NC_008566	TAC	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621710
124	NC_008566	AAC	2	6	3576	3581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621710
125	NC_008566	ACC	2	6	3582	3587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621710
126	NC_008566	AATT	2	8	3599	3606	50 %	50 %	0 %	0 %	117621710
127	NC_008566	CAA	2	6	3680	3685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621710
128	NC_008566	TTA	2	6	3727	3732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621710
129	NC_008566	TTA	2	6	3763	3768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621710
130	NC_008566	TTAT	2	8	3778	3785	25 %	75 %	0 %	0 %	117621710
131	NC_008566	TATT	2	8	3816	3823	25 %	75 %	0 %	0 %	117621711
132	NC_008566	A	7	7	3824	3830	100 %	0 %	0 %	0 %	117621711
133	NC_008566	A	6	6	3867	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	117621711
134	NC_008566	A	7	7	3878	3884	100 %	0 %	0 %	0 %	117621711
135	NC_008566	A	6	6	3886	3891	100 %	0 %	0 %	0 %	117621711
136	NC_008566	A	6	6	3899	3904	100 %	0 %	0 %	0 %	117621711
137	NC_008566	TAA	2	6	3929	3934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008566	A	6	6	3933	3938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008566	TAT	3	9	3945	3953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008566	T	6	6	3994	3999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008566	TTTC	2	8	4096	4103	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008566	ATAAA	2	10	4112	4121	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008566	GAA	2	6	4125	4130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008566	TA	3	6	4144	4149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008566	A	6	6	4149	4154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008566	TTA	2	6	4197	4202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008566	TTAT	2	8	4221	4228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008566	TTAA	2	8	4241	4248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008566	AATTTT	2	12	4284	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621712
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